שיעור א'
שיעור א' במדרשת נשמת מיועד לבוגרות שירות לאומי או צבאי אשר שואפות להיכנס לעולם לימוד התורה הגבוה. בבית המדרש תמצאי חיי תורה תוססים ומשמעותיים, וחבורה אכפתית החותרת להעמקה ולהתקדמות בעבודת ה'. תחשפי לדעות ולגישות מגוונות באווירה מקבלת ופתוחה, וכן תקשרי קשרים משמעותיים עם חברות ואנשי צוות אשר ילווך למשך שנים.  הלימוד במדרשה הוא בכל מרחבי התורה– תלמוד, הלכה, תנ"ך, מדרש, מחשבה וחסידות, תוך מתן דגש חזק על קניין כלים ולימוד תורה פעיל. בין היתר עוסקים גם בהתמודדויות בבניין חיי משפחה בזמננו ובסוגיות חברתיות חשובות בבית המדרש החברתי של כלל המדרשה.

מעיין א'
שנת מדרשה בשילוב הכנה ללימודי תואר אקדמי לבנות הקהילה האתיופית. במדרשת נשמת תמצאי מגוון עשיר של לימודי תורה: תנ"ך, הלכה, חסידות, מחשבת ישראל, מסילת ישרים, הבית היהודי, ועוד. הודות לפסק הזמן שתלמידות מעין א' לוקחות ממרוץ החיים, הן עוברות במדרשה תהליך של בניין רוחני. המדרשה מלווה את תלמידות מעיין א' בכניסתן לעולם האקדמיה (אוניברסיטאות, מכללות) מתוך רצון לממש את הכישורים הפנימיים של כל בת, ובכדי להשתלב בהמשך בשוק התעסוקה במקצוע איכותי שיש בו גם מימוש עצמי וגם פרנסה בכבוד. התוכנית כוללת קורס פסיכומטרי וסדנאות שבועיות.

קרן אריאל – להכשרת יועצות הלכה
תוכנית "קרן אריאל" להכשרת יועצות ההלכה בנשמת היא תוכנית ממולגת דו-שנתית, ללימוד מקיף של הלכות נידה בהנחיית פוסקים ותלמידי חכמים מובהקים. בצד לימודי ההלכה, משתתפות התלמידות בלימודי השלמה ברפואת נשים והלכה, ובסדנאות בנושאי זוגיות ומשפחה. מועמדות לתוכנית קרן אריאל נבחרות בהתאם לכישוריהן הלימודיים בגמרא ופוסקים, ומסירותן והזדהותן העמוקה עם עולם ההלכה. נבחנים גם כישורי מנהיגות ויכולתן העתידית לתרגם את הידע הלימודי לתרומה ממשית לקהילה ולחברה.

תוכניות חו"ל
תוכנית שנה בארץ- מיועדת לבוגרות תיכון דוברות אנגלית, ומהווה הזדמנות לחוות לימוד תורה מעמיק ומאתגר והתפתחות רוחנית יחד עם חוויה ישראלית לצד בנות מדרשה ישראליות.

תכנית עליסה
מיועדת לנשים דוברות אנגלית מכל רחבי העולם, ומאפשרת לימוד תורה מאתגר, בדגש על הקניית כלים ופיתוח מיומנויות יחד עם עיסוק במהות היהדות וחיבור בין נשים מרקעים וגילאים מגוונים. התוכנית מיועדת לכל רמות הלימוד, מתחילות ומתקדמות.